《破冰行动》大结局是以李飞为首的“雷霆扫毒专项行动”圆满完成，贩毒的窝点也被警方一锅端起，但是民警李飞的亲生父亲却死了;马雯在最后行动中中枪成为植物人，而李飞最后远走新疆，陈珂和李飞也并没有在一起。

　　《破冰行动》各个人物的结局

除了李飞、马雯、李飞父亲、陈珂的结局外，里面的林耀东、林耀华、林天昊、林灿因犯故意杀人罪，制造贩卖毒品罪，被依法判处死刑，剥夺政治权利终身，没收个人全部财产。

陈文泽和马云波波因严重违纪被开除党籍和公职，涉嫌受贿渎职，为制毒贩毒分子充当保护伞，分别判刑15年、12年。刘浩宇、黄达成、方天逸因犯走私,贩卖毒品罪，洗钱罪，被依法判处死刑，剥夺政治权利终身;林景文因制造贩卖毒品罪，并依法判处无期徒刑。一举将贩毒集团连根拔起，这场声势浩大的缉毒行动大获全胜，告别黑暗，迎来光明。

在电视剧最后几分钟，陈珂收到李飞从新疆的来信，从李飞的信中可以看出马雯并没有死，正在恢复。李飞在经历过“破冰行动”之后，开启了新的征程。