格兰特上校牺牲后，20号分部群龙无首，甚至面临被解散的危险。

另恐怖份子闻风丧胆的特种精英斯坦布奇坐上了办公室，在特种空勤团训练基地训练士兵，然而教官也并没有那么轻松，实弹训练中，一位队员精神失控向队友射击，斯坦布奇不得不开枪将其击杀。这名队员的哥哥—克瑞格·汉森为了报复斯坦布奇也杀死了其妻子。

斯科特负责转移一名寻求政治避难的利比亚人，却被当地军阀绑架，斯科特孤身救援却也身陷囹圄。斯坦布奇为了营救老搭档重新出山，与瑞姆深入敌营，却卷入一场危机四伏的阴谋。

另外新一季的20号分部迎来了新成员：为了完成任务不惜一切代价—瑞秋·道尔顿少校和巴克斯特中士，与斯科特、斯坦布奇、瑞姆和辛克莱尔搭档在非洲大陆展开新的反恐故事。