蜂蜜是一种弱酸性食品，存放蜂蜜的容器最好用玻璃或陶瓷器皿。蜂蜜不宜长期存放在铁、铅等金属器皿中，以免游离重金属污染蜂蜜。用无毒塑料瓶存放的蜂蜜，时间也不宜过长。

装入容器的蜂蜜，最好加盖密封，避免与潮湿空气接触，以免发酵。应放在清洁、阴凉通风的地方，最好放在冰箱里保存，注意避免污染。

大批量的蜂蜜应采用缸、木桶、塑料桶等进行包装，对专用包装容器要彻底洗净擦干。在蜂蜜产量较高的地区，可以建立蜂蜜贮存池，也可用木桶或水缸存放，所用桶、缸应不带异味。包装蜂蜜不能盛满，特别是在运输时要留出25％－30％的空间，以防蜜汁发酵外溢或受热振荡时胀破容器。