太阳黑子最早记录在公元前28年，当时是西汉时期，皇帝是汉成帝。

西汉河平元年（公元前前28）三月所见的太阳黑子现象，载于《汉书·五行志》：“河平元年……三月己未，日出黄，有黑气大如钱，居日中央。”

在西方，太阳黑子长期被忽视。亚里士多德认为太阳是完美无缺的，因而太阳上不会有黑点的观点一致持续到17世纪。公元1610年，意大利天文学家伽利略首次用望远镜看到了太阳黑子，发现黑子是太阳表面非常普遍的现象。不过，这一观测结果与当时的宗教教义相抵触。从1818年开始才有比较常规的每日黑子观测，从而有比较可靠的黑子资料。1610年—1818年间的黑子记录资料是不连贯和不均匀的，存在各种系统误差，尤其是1750年以前的观测记录存在很大的不确定性。

太阳黑子的常规观测不仅让我们认识到太阳黑子自身的变化规律，同时也揭示了太阳上的其他现象和规律。如太阳磁场、太阳自转、白光耀斑都是在黑子观测中被发现的。