1885年台湾正式建省由刘铭传任台湾首任巡抚。清光绪年间因英法列强先后觊觎台湾，闽浙总督上书朝廷，要求福建与台湾两地巡抚分驻、建省分治。1885年慈禧太后下旨创建海军的同时，下诏闽台分治；9月5日，宣布台湾建省，但建省行政工作至1887年才完成，正式名称则为福建台湾省，首任台湾巡抚（1887年更名为福建台湾巡抚）为刘铭传。台湾省下设3府（台北府、台湾府、台南府），11县（宜兰县、淡水县、新竹县、苗栗县、台中县、彰化县、云林县、诸罗县、安平县、凤山县、恒春县），4厅（基隆厅、南雅厅、埔里社厅、澎湖厅）以及1直隶州（台东直隶州）。