孔德成有后代，有二子二女、孙儿女四人，曾孙儿女二人。长女孔维鄂、长子孔维益、次女孔维崃、次子孔维宁。四个孩子都是孔德成与孙琪方所生。

孔德成是孔子第77代孙，袭封31代衍圣公，也是最后一代衍圣公。

1949年4月，应国民党当局之请迁往台湾，自1955年起，于台湾大学中文系、人类学系兼任教授。至2008年初，方因病辍教。同年10月28日，因肺炎并发败血症、心肺功能衰竭病逝，享寿88岁。