燕京大学大部分被北京大学继承，但并不是完全完全继承。

在50年代燕京大学被拆分合并为数所高校，其中燕京大学民族学系、社会学系、语文系、历史学系并入中央民族学院（今中央民族大学）；燕京大学法学院参与组建北京政法学院（今中国政法大学）；燕京大学经济学系参与组建中央财经学院（今中央财经大学）；燕京大学工学院并入清华大学，燕京大学文学院、理学院并入北京大学。

北京大学吸纳了燕京大学大部分人才并同时搬入燕园的北京大学从人员和设施配套（包括图书馆）上均在一定程度上继承了燕京大学的角色，因此认为北京大学可以在某程度上称为燕京大学的传承者。